Le FC Annecy a fait un grand pas en avant en enregistrant quatre nouvelles recrues pour sa réserve qui évoluera en National 2 pour la première fois de son histoire. Cette accession, couplée à celle des U18 R1 en U19 Nationaux, a entraîné un mercato actif en ce mois de juin. Parmi les nouvelles recrues, l'attaquant Sonny Yvars, précédemment avec Saint-Étienne U19, et le milieu axial Tom Palma, qui a rejoint le club après une saison à Valence R1, se distinguent. L'ailier malgache Olivier Picabea, âgé de 23 ans, a également signé après avoir terminé sa saison à La Tamponnaise en R1 La Réunion. Enfin, le défenseur central ou latéral droit Yoann Dumay, formé à Strasbourg, a également rejoint le FCA après avoir joué à Alençon en N3.

Cependant, le club doit également faire face à des départs significatifs. Treize joueurs quitteront le FC Annecy, dont des figures emblématiques comme le milieu et capitaine Yanis Méguirèche, qui a passé 15 ans au club, et le défenseur central Théo Falconnier, qui a défendu les couleurs annéciennes pendant 17 ans. D'autres joueurs, tels que l'attaquant Ibrahim Raache et plusieurs défenseurs et milieux, ne continueront pas l'aventure avec le club. Ces changements marquent une période de transition pour le FC Annecy, qui espère construire une équipe compétitive pour sa première saison en National 2.